Uso de grupos ortólogos e busca por ilhas de patogenicidade na identificação de três espécies de bacillus

Abstract

B. anthracis, o agente etiológico da doença antraz, B. cereus, uma bactéria que pode causar infecções gastrointestinais e B. thuringiensis. produtora de cristais tóxicos (Cry) que atuam como inseticidas espécie-específicos naturais são bactérias muito parecidas geneticamente entre si. Diferenciá-las através de métodos moleculares é um grande desafio. O objetivo deste trabalho foi aplicar abordagens de genômica comparativa para classificar estas espécies. Para isso, as proteínas preditas de 45 genomas sendo 10 genomas de cada espécie disponíveis publicamente no NCBI, 14 genomas de B. thuringiensis do banco de dados interno da Embrapa e uma espécie outgroup foram usadas para a identificação de grupos ortólogos e confecção de uma árvore filogenética, totalizando 268.898 proteínas. A análise filogenética separou, em termos gerais, B. anthracis das demais, ainda que as três espécies se misturem entre si em maior ou menor grau. Cepas de B. thuringiensis com ação bio-inseticidas de lepidópteros ficaram separadas daquelas que atuam em coleópteros. B. anthacis é a espécie que apresenta, em média, o menor número e B. thuringiensis, o maior número de ilhas de patogenicidade por genoma. Este trabalho mostrou que através da classificação em grupos ortólogos e análise de ilhas de patogenicidade é possível melhorar a classificação destas três espécies baseado em dados moleculares